MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 plasmid A

Total Repeats: 789

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010539	CTG	2	6	28	33	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034821
2	NC_010539	TTA	2	6	167	172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034821
3	NC_010539	TTTGTT	2	12	294	305	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	172034821
4	NC_010539	GTT	2	6	351	356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034821
5	NC_010539	GGT	2	6	425	430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034821
6	NC_010539	ACA	2	6	537	542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034821
7	NC_010539	TTC	2	6	553	558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034821
8	NC_010539	TGG	2	6	634	639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034821
9	NC_010539	ACG	2	6	678	683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034821
10	NC_010539	CAT	2	6	684	689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034821
11	NC_010539	TGAT	2	8	703	710	25 %	50 %	25 %	0 %	172034821
12	NC_010539	TGA	2	6	719	724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034821
13	NC_010539	G	7	7	728	734	0 %	0 %	100 %	0 %	172034821
14	NC_010539	GA	3	6	743	748	50 %	0 %	50 %	0 %	172034821
15	NC_010539	TGT	2	6	754	759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034821
16	NC_010539	AGT	2	6	760	765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034821
17	NC_010539	TAT	2	6	789	794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034821
18	NC_010539	CTA	2	6	795	800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034821
19	NC_010539	TCA	2	6	830	835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034821
20	NC_010539	ATC	2	6	922	927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034821
21	NC_010539	ATT	2	6	937	942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034821
22	NC_010539	GTT	2	6	969	974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034821
23	NC_010539	AT	3	6	983	988	50 %	50 %	0 %	0 %	172034821
24	NC_010539	T	7	7	1077	1083	0 %	100 %	0 %	0 %	172034821
25	NC_010539	AGG	2	6	1110	1115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172034821
26	NC_010539	GCT	2	6	1259	1264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034821
27	NC_010539	TGT	2	6	1523	1528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034821
28	NC_010539	A	6	6	1754	1759	100 %	0 %	0 %	0 %	172034821
29	NC_010539	GTTCTT	2	12	1764	1775	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	172034821
30	NC_010539	C	6	6	1789	1794	0 %	0 %	0 %	100 %	172034821
31	NC_010539	CGA	2	6	1814	1819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034821
32	NC_010539	TGG	2	6	1887	1892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034821
33	NC_010539	TCA	2	6	1908	1913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034821
34	NC_010539	TGG	2	6	1926	1931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034821
35	NC_010539	GCT	2	6	1994	1999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034821
36	NC_010539	TCAA	2	8	2012	2019	50 %	25 %	0 %	25 %	172034821
37	NC_010539	TTG	2	6	2035	2040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034821
38	NC_010539	GGT	2	6	2042	2047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034821
39	NC_010539	A	6	6	2085	2090	100 %	0 %	0 %	0 %	172034821
40	NC_010539	CCT	2	6	2108	2113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034821
41	NC_010539	CCA	2	6	2124	2129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034821
42	NC_010539	TCC	2	6	2143	2148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034821
43	NC_010539	GTT	2	6	2271	2276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034821
44	NC_010539	ATG	2	6	2301	2306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034821
45	NC_010539	CTG	2	6	2316	2321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034821
46	NC_010539	TTC	2	6	2323	2328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034821
47	NC_010539	TTC	2	6	2338	2343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034821
48	NC_010539	GGC	2	6	2398	2403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172034821
49	NC_010539	AAGT	2	8	2473	2480	50 %	25 %	25 %	0 %	172034821
50	NC_010539	TGT	2	6	2525	2530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034821
51	NC_010539	TG	3	6	2543	2548	0 %	50 %	50 %	0 %	172034821
52	NC_010539	CAC	2	6	2572	2577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034821
53	NC_010539	TGG	2	6	2620	2625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034821
54	NC_010539	TCT	2	6	2675	2680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034821
55	NC_010539	TCGTT	2	10	2810	2819	0 %	60 %	20 %	20 %	172034821
56	NC_010539	GTC	2	6	2840	2845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034821
57	NC_010539	CCT	2	6	2859	2864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034821
58	NC_010539	GCA	2	6	2877	2882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034821
59	NC_010539	GGT	2	6	2979	2984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034821
60	NC_010539	GCT	2	6	2987	2992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034821
61	NC_010539	CTA	2	6	2994	2999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034821
62	NC_010539	CTT	2	6	3009	3014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034821
63	NC_010539	TCA	2	6	3144	3149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034821
64	NC_010539	GAG	2	6	3193	3198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172034821
65	NC_010539	TCA	2	6	3239	3244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034821
66	NC_010539	AGGT	2	8	3301	3308	25 %	25 %	50 %	0 %	172034821
67	NC_010539	TCA	2	6	3350	3355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034821
68	NC_010539	C	8	8	3404	3411	0 %	0 %	0 %	100 %	172034821
69	NC_010539	CTT	2	6	3438	3443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034821
70	NC_010539	TTC	2	6	3486	3491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034821
71	NC_010539	TGT	2	6	3558	3563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034821
72	NC_010539	CGT	2	6	4678	4683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034822
73	NC_010539	TGA	2	6	4687	4692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034822
74	NC_010539	ATT	2	6	4740	4745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034822
75	NC_010539	ATG	2	6	4764	4769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034822
76	NC_010539	CTTTC	2	10	4787	4796	0 %	60 %	0 %	40 %	172034822
77	NC_010539	TTAGT	2	10	5069	5078	20 %	60 %	20 %	0 %	172034823
78	NC_010539	G	7	7	5089	5095	0 %	0 %	100 %	0 %	172034823
79	NC_010539	GTT	2	6	5133	5138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034823
80	NC_010539	CAG	2	6	5143	5148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034823
81	NC_010539	TTA	2	6	5161	5166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034823
82	NC_010539	GGA	2	6	5214	5219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172034823
83	NC_010539	TGA	2	6	5253	5258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034823
84	NC_010539	GCT	2	6	5284	5289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034823
85	NC_010539	GATTAT	2	12	5290	5301	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	172034823
86	NC_010539	CAAC	2	8	5383	5390	50 %	0 %	0 %	50 %	172034823
87	NC_010539	CAGT	2	8	5443	5450	25 %	25 %	25 %	25 %	172034823
88	NC_010539	GGT	2	6	5455	5460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034823
89	NC_010539	A	6	6	5511	5516	100 %	0 %	0 %	0 %	172034823
90	NC_010539	TTA	2	6	5557	5562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034823
91	NC_010539	GTG	2	6	5569	5574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034823
92	NC_010539	GTCA	2	8	5606	5613	25 %	25 %	25 %	25 %	172034823
93	NC_010539	ATT	2	6	5673	5678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034823
94	NC_010539	AGG	2	6	5681	5686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172034823
95	NC_010539	GAT	2	6	5721	5726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034824
96	NC_010539	CAA	2	6	5772	5777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034824
97	NC_010539	AGA	2	6	5792	5797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034824
98	NC_010539	AATC	2	8	5799	5806	50 %	25 %	0 %	25 %	172034824
99	NC_010539	AAG	2	6	5827	5832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034824
100	NC_010539	CGA	2	6	5893	5898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034824
101	NC_010539	TGT	2	6	5992	5997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034824
102	NC_010539	GAT	2	6	6000	6005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034824
103	NC_010539	GCG	2	6	6133	6138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172034825
104	NC_010539	TTC	2	6	6147	6152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034825
105	NC_010539	T	6	6	6173	6178	0 %	100 %	0 %	0 %	172034825
106	NC_010539	TTC	2	6	6219	6224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034825
107	NC_010539	TAA	2	6	6228	6233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034825
108	NC_010539	CTT	2	6	6239	6244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034825
109	NC_010539	TCT	2	6	6299	6304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034825
110	NC_010539	TTG	2	6	6315	6320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034825
111	NC_010539	TTTA	2	8	6357	6364	25 %	75 %	0 %	0 %	172034825
112	NC_010539	CAA	2	6	6371	6376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034825
113	NC_010539	ACAAG	2	10	6481	6490	60 %	0 %	20 %	20 %	172034825
114	NC_010539	CTGT	2	8	6565	6572	0 %	50 %	25 %	25 %	172034825
115	NC_010539	AAT	2	6	6573	6578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034825
116	NC_010539	T	7	7	6626	6632	0 %	100 %	0 %	0 %	172034825
117	NC_010539	TGA	2	6	6683	6688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034825
118	NC_010539	TCA	4	12	6716	6727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034825
119	NC_010539	CTTT	2	8	6935	6942	0 %	75 %	0 %	25 %	172034826
120	NC_010539	GAG	2	6	6943	6948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172034826
121	NC_010539	A	7	7	6949	6955	100 %	0 %	0 %	0 %	172034826
122	NC_010539	TTA	2	6	6964	6969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034826
123	NC_010539	TAA	2	6	6989	6994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034826
124	NC_010539	GAA	2	6	7030	7035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034826
125	NC_010539	TTA	2	6	7128	7133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034827
126	NC_010539	AGA	2	6	7141	7146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034827
127	NC_010539	GATT	2	8	7221	7228	25 %	50 %	25 %	0 %	172034827
128	NC_010539	TAT	3	9	7306	7314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034827
129	NC_010539	GT	3	6	7370	7375	0 %	50 %	50 %	0 %	172034827
130	NC_010539	TATT	2	8	7378	7385	25 %	75 %	0 %	0 %	172034827
131	NC_010539	AAGGAA	2	12	7431	7442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034827
132	NC_010539	TGAT	2	8	7452	7459	25 %	50 %	25 %	0 %	172034827
133	NC_010539	ATT	2	6	7496	7501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034827
134	NC_010539	CGG	2	6	7647	7652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172034828
135	NC_010539	AAG	2	6	7671	7676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034828
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401	NC_010539	TAA	2	6	20182	20187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034838
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